二元液相色谱仪具有制冷功能的柱温箱—柱温箱不仅能升温还可制冷，满足较高温度分离条件到相对较低温度分离条件的转变，采用了全新的弹出式阀和用户可更换的阀头，显著增加了可用性，为超高通量、多方法和自动化方法开发解决方案铺平了道路。
二元液相色谱仪工作方式：双泵并联，可同时有两个流动相，按照预先设定的配比进入，再高压下进行混合，混合配比更准确，不易产生气泡，不用为了转换流动相而反复清洗，提高了工作效率。同时可以做梯度洗脱，当待测样品成分复杂，用一个固定的流动相配比无法将样品中成分*分开时，就需要用到梯度洗脱，在同一个分析过程中由仪器自动改变流动相配比，将样品中前次无法分离的物质进行洗脱，在同一谱图中得到分开的峰的效果。有助于提高分析准确性，避免遗漏重要物质的检测。
四元液相色谱仪工作方式：可同时有四个流动相进入流路，按照预先设定的配比进行混合，由于在常压下混合所以较易产生气泡，因此必须配备在线脱气机，可消除气泡影响。可以做梯度洗脱，在仪器上进行设定之后，在同一样品分析工程中，相隔一段时间后，按照用户设定的配比自行改变流动相配比，将样品中所有组分分离开来，有助于提高分析准确性。做简单的分析，一般性的化合物用二元的系统就很好，如果做蛋白类，多肽等半制备或梯度洗脱还是四元系统方便，但需配在线脱气机。
二元高压混合和四元低压混合的一个重大区别就是前者进入输液泵后立即进行混合，而后者是进泵以后慢慢混合，有的还要过一混合器，混合不但置后，而且效果明显不如前者。二元的价格比四元的贵，两种类型的液相色谱仪在性能上各有优缺点。
